4 февраля 2011 года в СМИ появилось сообщение о том, что журналист Геннадий Павлюк был выброшен в Киргизии с шестого этажа бывшим сотрудником спецслужбы Алдаяром Исманкуловым. После предъявления ему обвинения стало известно, что согласно уголовному кодексу судить его будут в Казахстане, так как это преступление гражданин Киргизии совершил на территории этой страны. И задержание подозреваемого произошло там же. Тот факт, что обвиняемый оказался бывшим сотрудником спецслужб, свидетельствует о том, что убийство, произошедшее в декабре 2010 года, связано с профессиональной деятельностью Геннадия Павлюка. Алдаяру Исманкулову, задержанному по подозрению в убийстве, 34 года. Следователем департамента внутренних Алма-Аты, где произошло убийство, предъявлено обвинение Исманкулову по шести статьям УК, среди которых: «похищение убитого группой лиц с применением насилия и по предварительному сговору», «убийство с особой жестокостью», «вымогательство». Очевидным является тот факт, что Геннадий погиб из-за профессиональной деятельности. Вероятнее всего, он осмелился высказать своё мнение, которое кому-то не понравилось. Эту информацию подтверждают и представители киргизской Генеральной прокуратуры. Они сообщили о результатах части следственных мероприятий, проведённых на территории Киргизии. Казахские коллеги обращались в Генеральную прокуратуру Киргизии с запросом, и они оказали им содействие на территории своей страны. Исманкулов проходит так же по делу о незаконном хранении оружия, что явилось поводом к тому, что власти Киргизстана сделали запрос об экстрадиции этого гражданина. Но Казахская сторона не торопится с ответом.
Спустя месяц после гибели журналиста, В Киргизстане была учреждена премия имени Геннадия Павлюка. Она будет присуждаться за мужество, а так же за стойкость в борьбе за свободу слова, демократию и права человека.